Você controla um(a) agente da ADAMAS que testemunha um fenômeno catastrófico em Shinjuku, Tóquio, e acorda oito anos no passado. Agora, viaja entre o Mundo Humano e o Digital (Iliad), forjando laços com Digimons e tentando impedir o colapso iminente. A trama une passado e futuro, com humanos e Digimons entrelaçados